故事发生的舞台是日本静冈县清水市（从2005年起成为静冈县静冈市清水区），那是一个不折不扣的美丽港都，是个交通便利、渔产丰富、又与富士山为邻的好地方。故事围绕着小丸子以及其家人和同学展开，有关于亲情、友谊等，或是一些生活小事，但当中有笑有泪，令人回想起童年的稚气.最特别的，当在故事人物尴尬时的招牌表情，会突然出现在脸上的黑线，有时还会伴随着一阵寒风从头后吹过。