作品以全国编号649的钢虫神（ゲノセクト）为主题。钢虫神是钢系和虫系的口袋妖怪，曾是三亿年前的最强猎手，其化石被等离子团发现后复活再改造而成，同时也变得更加强大，被等离子团的人称为史上最强口袋妖怪。在剧场版动画中，除了可以见到通常的紫色钢虫神以外，还可以见到一只独特的红色钢虫神，具有更强的高速飞行能力。