一个叫亨利的13岁男孩在度假途中，在他的旅行箱里意外发现了一种长着尖耳朵、翘门牙、细尾巴的微型小人——“小不点”。此后，他们就住在亨利卧室的通风道里，亨利的宠物龟也成了他们的好朋友。美国动画片中与孩子们作对的反派角色总是大人，如《丹佛——最后的恐龙》。本片也不例外，阴森的博士和他的助手总是带着高尖端科技的仪器，妄图捕获这些小家伙。凭借小不点们自身的聪明伶俐和亨利无微不至的保护，大人们的阴谋一次次的破产了。