《艾莉森与莉莉亚》是时雨名为《艾莉森》、《莉莉亚&特雷兹》的两部轻小说融合在一起的故事，原作本来就有连续性，所以动画就干脆将它们改编到了一起。动画的前半部分讲的是妈妈艾莉森和孤儿院的青梅竹马——威鲁少年的寻宝冒险故事。后半部分则从《莉莉亚&特雷兹》中选取了一部分，讲的是艾莉森与威鲁的女儿莉莉亚，和男友特雷兹的故事。